Da Napoli: la nave della compagnia Siremar, che parte alle 8 di sera e arriva alle 09,30 del mattino o l’aliscafo Siremar. Da Messina e da Milazzo ci sono diversi traghetti ed aliscafi. L’aeroporto principale per raggiungere Filicudi è quello di Catania Fontana Rossa che garantisce frequenti collegamenti con Milazzo.